Di bangunan kayu yang artistik ini, pengunjung akan disambut dengan beragam karya seni khas Papua yang memiliki nilai historis dari budaya leluhur. Kerajinan di Yayasan Istana Merauke dibuat langsung oleh para pengrajin yang berasal dari suku-suku asli Papua seperti suku Marind, Muyu, Mappi, Asmat, dan Wamena dengan filosofi budaya yang berbeda untuk masing – masing daerah. Selain kaya akan makna budaya, kerajinan tangan disini juga dibuat dengan memanfaatkan bahan baku dari alam, seperti biji – bijian, kulit dan batang kayu, rumput rawa, dedaunan, dan tulang hewan. Bahan-bahan tersebut kemudian dibentuk menjadi beragam souvenir seperti perhiasan (gelang, kalung, anting dan cincin), ukiran dan lukisan, hiasan dinding, dompet, noken, dan mahkota kepala dari burung. (Untuk melihat katalog klik link). Tak hanya kerajinan tangan, Yayasan ini juga menyediakan obat – obatan tradisional dari buah merah dan sarang semut (musamus) asli Papua yang dipercaya dapat menyembuhkan berbagai macam penyakit.